山东中医药大学创建于1958年，1978年被确定为全国重点建设的中医院校，1981年成为山东省重点高校，是教育部本科教学工作水平评估优秀学校、山东省首批五所应用基础型人才培养特色名校之一，山东省首批高等学校协同创新中心。山东中医药大学在省属高校中拥有国家级重点学科最多，最早获得硕士、博士学位授权，最早设立博士后科研流动站，最早成为国家“973”项目首席承担单位。
山东中医药大学秉承“厚德怀仁，博学笃行”的校训，发挥中医药优势，狠抓内涵建设，逐步形成“以文化人、厚重基础、注重传承、勇于创新”的办学特色，为国家和社会培养了数以万计的专门人才。山东中医药大学培养的人才具有“敦厚朴实、基础扎实、工作踏实”的鲜明特点，涌现出一批“全国三好学生”、“中国大学生自强之星标兵”、“山东青年五四奖章”荣誉获得者等优秀学生。
山东中医药大学致力于高水平中医药特色名校建设，2007年由济南市历下区主体迁入扁鹊故里——长清，总占地1829亩，建筑面积54.5万平方米。学校图书馆馆藏纸质图书187.1万册、电子图书50.9万册、古籍善本3万册，为山东省古籍重点保护单位。设置15个二级学院，4个科研机构，拥有3所直属附属医院、12所非直属附属医院、25所教学医院、97处实践教学基地、10家山东省研究生联合培养基地,18家中医局住院医师规范化培训基地。有1个国家级实验教学示范中心、1个国家级大学生校外实践教育基地。
山东中医药大学坚持立德树人、大医精诚，努力培养高素质人才。拥有25个本科专业，涉及医、理、文、工、管、法、教育等学科门类；有中医学、中药学、中西医结合3个博士学位授权一级学科、15个博士点，8个硕士学位授权一级学科、44个硕士点，学位点涵盖了中医学、中西医结合、中药学全部二级学科；拥有中医学博士专业学位授予权和中医学、中药学、药学、生物医学工程硕士专业学位授予权。截至目前，山东中医药大学全日制在校生21000人，其中研究生2800余人。山东中医药大学与近30所国外知名大学、医疗机构建立了长期友好合作关系。
山东中医药大学坚持师德为先、教学为要，拥有实力雄厚的师资队伍。现有教职医护员工3900余人。其中博士生导师127人，硕士生导师589人。荣获国家“国医大师”荣誉称号者3人，“973”项目首席科学家1人，全国优秀教师10人，山东省教学名师10人，山东省“泰山学者”特聘教授9人，省部级有突出贡献的中青年专家24人，享受国务院特殊津贴专家51人，山东省名中医药专家86人。有山东省优秀教学团队6个，山东省十大优秀创新团队1个。
山东中医药大学推拿学和制药工程4个国家级特色专业，11个省级特色专业；建设3门国家级精品开放课程、33门省级精品课程。
山东中医药大学注重科技创新驱动，打造一流科研平台，取得丰硕成果。现有中医学、中药学、中西医结合3个博士后科研流动站，设有1个国家教育部重点实验室、6个国家中医药管理局三级重点实验室，2个国家中医药管理局重点研究室、2个山东省重点实验室、3个山东省工程技术研究中心、1个山东省示范工程技术研究中心、1个山东省工程实验室，1个山东省中医药抗病毒协同创新中心，7个山东省高校科研创新平台。“十二五”期间，共承担厅局级以上科研课题780项，其中国家级项目104项，连续三年获得山东省科技进步一等奖。建校以来，获国家级和省部级一等奖奖励的科研成果共计23项。拥有国家中医临床研究基地、国家重大新药创制平台（山东）中药单元平台。
在建设高水平中医药大学的征程上，山东中医药大学始终坚持社会主义办学方向，全面贯彻党的教育方针，牢固树立创新、协调、绿色、开放、共享的发展理念，以立德树人为根本，以创新驱动发展、服务地方经济社会为导向，坚持人才培养的中心地位和中医药学科专业的核心地位，突出中医药特色优势，注重文化传承创新，强化内涵建设，深化教学改革，不断提高人才培养质量，全面提升学校的综合实力和办学水平，努力培养德智体美全面发展的中国特色社会主义合格建设者和可靠接班人。