哈尔滨医科大学是国务院学位委员会首批批准的具有博士、硕士、学士三级学位授予权的单位之一。自1978年我国恢复研究生招生制度和1981年实施学位制度以来，我校学位与研究生教育取得了令人瞩目的发展。哈尔滨医科大学确立了“以学科建设为根本，以本科教育为基础，积极发展研究生教育和长学制医学教育，适应国家及区域医药卫生事业发展和经济建设的需要，成为培养创新型医学人才、产出高水平科研成果和提供高质量医疗服务的重要基地，努力把哈尔滨医科大学建设成为国内一流、国际有影响的研究教学型医科大学。”的办学指导思想，在工作中解放思想、实事求是、抓住机遇、深化改革，使教学、医疗、科研整体水平和综合实力呈现出奋发向上的态势。
哈尔滨医科大学现有博士学位授权一级学科点8个（基础医学、临床医学、公共卫生与预防医学、生物学、药学、护理学、生物医学工程、公共管理），博士学位授权二级学科点57个，硕士学位授权一级学科点11个，硕士学位授权二级学科点61个，涵盖法学、理学、工学、医学、管理学五个学科门类。
哈尔滨医科大学有国家级重点学科3个，省级重点学科（群）35个，国家临床重点专科14个，省部共建国家重点实验室培育基地1个，部省级重点实验室11个，省普通高校重点实验室13个。哈尔滨医科大学有中国工程院院士1人，获南丁格尔奖1人，国务院学位委员会学科评议组成员3人，国家级教学名师4人，全国医学专业学位教育指导委员会委员3人，有国家“长江学者”讲座教授1人、省“龙江学者”特聘教授17人，享受国务院政府特殊津贴97人，留学归国人员610余人，在岗博士生导师244人，硕士生导师935人。主持国家“973”项目、“863”项目、国家“十一五”科技支撑计划、国家自然科学基金项目400余项，有着雄厚的基础和广阔的平台来承载研究生教育。
哈尔滨医科大学先后开展了同等学力人员申请硕士学位、临床医学博士专业学位、临床医学硕士专业学位、口腔医学硕士专业学位、公共卫生硕士专业学位、药学硕士专业学位、护理硕士专业学位、高等学校教师在职攻读硕士学位、从港、澳、台人士中招收硕士生及与拉筹伯大学合作举办社会医学与卫生事业管理硕士研究生等，形成了多种形式、多条渠道培养研究生的新格局。
从1978年至今共招收全日制研究生15285人（其中博士生2470人、硕士生12815人），授予博士学位1669人（获国家优秀博士论文1篇）、硕士学位8580人。2012年全日制研究生招生规模达1562人（其中博士生230人、硕士生1332人），目前在校全日制研究生4469人（其中博士生673人、硕士生3796人）。
三十多年来，在上级领导的大力支持和哈尔滨医科大学党委的正确领导下，在哈尔滨医科大学各部门的支持配合下，经过全体研究生指导教师和从事研究生管理工作人员的辛勤努力，我校学位与研究生教育工作取得了巨大的成绩，研究生招生规模不断扩大，学位授权点数量不断增加，研究生培养质量不断提高，学位与研究生教育管理日益规范化、科学化，我校已经成为高层次医学专门人才的培养基地之一。研究生学院2000年被黑龙江省教育委员会评为“黑龙江省学位与研究生教育管理工作先进集体”，2002年被黑龙江省教育厅评为“黑龙江省高等教育招生工作先进集体”，2004年获教育部“全国高等教育电子注册管理工作先进集体”，2012荣获教育部“全国高等教育学籍学历管理工作先进集体”荣誉称号。
哈尔滨医科大学研究生学院拥有一支年青、团结、精干的管理队伍，以提高研究生培养质量为中心目标，深化培养机制改革，积极探索适应创新型、复合型人才培养要求的管理方法，进一步完善管理制度，提升管理水平，志愿为学位与研究生教育的发展奉献力量！