安徽工业大学学位与研究生教育起始于1980年初，1990年获得硕士学位授予权。目前有13个一级学科硕士点，5个大类18个专业硕士点，2个一级学科博士点，1个博士后科研流动站。
设有冶金工程学院、材料科学与工程学院、化学与化工学院、机械工程学院、电气与信息工程学院、计算机科学与技术学院、建筑工程学院、能源与环境学院、管理科学与工程学院、商学院（商学院专业学位教育中心）、公共管理与法学院、数理科学与工程学院、艺术与设计学院、马克思主义学院、外国语学院、冶金减排与资源综合利用教育部重点实验室、分子工程与应用化学研究所和工程研究院等18个研究生教育培养单位。
安徽工业大学研究生教育以提高质量为核心，不断深化研究生教育改革。建立招生计划动态调整机制、学位点自我评估和调整机制；创新研究生培养过程管理和教育监管模式；健全质量保证与监督体系，构建科学的研究生分类分层培养体系，建立分流与淘汰机制，分类构建学术型、专业学位研究生质量标准；不断完善导师责权制度、导师项目资助制度和研究生奖助体系和学风建设；深化研究生教育的开放、合作与交流。