北京工商大学是北京市重点建设的多科性大学，1999年6月经教育部批准由北京轻工业学院与北京商学院合并，机械工业管理干部学院并入组建而成。北京商学院先后隶属商业部、国内贸易部，前身是中华全国供销合作总社干部学校和中央商业干部学校。
中华全国供销合作总社干部学校建于1950年初，中央商业干部学校建于1953年，1958年中华全国供销合作总社干部学校合并到中央商业干部学校。1959年商业部经国务院批准成立中央商学院，1960年更名为北京商学院，中央商业干部学校与北京商学院合并。1969年北京商学院因“文化大革命”停办，1978年经国务院批准恢复招生。北京商学院是我国建国后建立较早的专门培养经济管理人才的高等院校之一，是国务院批准的全国首批硕士学位授予单位。北京轻工业学院创建于1958年，是我国最早建立的一所轻工业高等学校。1970年迁入陕西省咸阳市，1978年经国务院批准在北京原址重建，先后隶属于轻工业部和中国轻工总会，主要面向轻工行业培养高级专门人才。机械工业管理干部学院建于1982年，隶属于机械工业部，主要是面向机械工业行业培养管理干部。迄今北京工商大学已为国家培养了十万余名各级各类专门人才。
合并组建后的北京工商大学步入了新的发展时期，综合实力显著增强，现已发展成为理、工、经、管、文、法、艺等学科相互支撑、协调发展的多科性大学，并将按照“特色、内涵、规范、质量”八字方针，努力实现特色鲜明的高水平研究型大学发展目标。
2007年6月，北京工商大学接受教育部全国普通高校本科教学工作水平评估。2008年3月，教育部召开全国普通高等学校本科教学工作评估专家委员会全体委员会议，经全体委员投票确定：北京工商大学本科教学工作的评估结果为“优秀”。
北京工商大学现设11个学院、1个教学部；拥有2个国家级检测中心、1个国家级实验教学示范中心、1个国家级虚拟仿真实验教学中心、1个国家工程实验室、1个科技部中国-加拿大联合实验室、1个北京市高精尖中心、4个北京市重点实验室、1个北京市实验室、1个北京高等学校工程研究中心、1个北京市工程技术研究中心、2个北京市研究基地、获批3个省部级协同创新中心、4个北京市高校实验教学示范中心；学校现有“服务国家特殊需求博士人才培养项目”1个，联合培养博士学位授权点1个，硕士学位授权点一级学科16个、硕士专业学位授权点19个（其中工程硕士专业领域7个）、本科专业50个；拥有北京市重点学科4个，北京市重点建设学科6个，国家级特色专业建设点5个，北京市特色专业建设点8个，国家级本科专业综合改革试点1个，北京市专业群建设与改革试点1个，北京市专业综合改革试点3个；2003年8月，经国务院学位委员会第20次会议审核批准，学校成为联合培养博士研究生单位，2004年起与中央财经大学联合招收和培养会计学专业博士研究生；2012年12月，学校食品（含保健食品）添加剂与安全成为“服务国家特殊需求博士人才培养项目”，授予学位学科名称为“食品科学与工程”。2014年9月，“食品科学与工程”学科获批新设博士后科研流动站。学校现有博士后9人（含联合培养3人），博士生23名，硕士生2384名，全日制普通高等教育本科生11329名，成人学历教育学生1611名。
学校总占地面积82万平方米（合1230.6亩），其中阜成路校区21万平方米，良乡校区61万平方米。总建筑面积45.68万平方米，其中阜成路校区19.88万平方米，良乡校区25.80万平方米。固定资产总值26.05亿元。图书馆馆舍总面积25793平方米，截至目前，馆藏纸质文献1679508册、中外文期刊921种、报纸67种、电子图书88.8万余种、数据库100个。
“十五”时期以来，抢抓机遇，积极拓展办学空间，不断完善基本条件，完成了阜成路校区改造和良乡校区一期等北京市重点工程建设项目，良乡校区新建面积达25.8万平方米，2004年10月，8千余名学生顺利入驻，良乡校区一期工程的建成，为莘莘学子的健康成长提供了良好的学习环境，为北京工商大学新时期跨越式发展奠定了坚实的物质基础。“十一五”及“十二五”时期，北京工商大学逐步完善阜成路校区和良乡校区的基础设施条件，积极推进良乡校区二期工程前期手续。“十三五”期间开工建设，实现“整合校园资源、优化办学空间、提升条件保障”的目标。