土木工程学院前身为1956年成立的建筑科，后设建筑工程系，2002年4月设为建筑与土木工程学院，2016年9月成立土木工程学院。建筑与土木工程学院下设土木工程、交通工程、工程管理、工程力学4个教学系和土木工程、交通工程、工程管理、工程造价、工程力学5个本科专业。拥有土木工程、管理科学与工程（工学）2个一级学科硕士学位授权点，工程力学二级学科硕士学位授权点，建筑与土木工程、工程管理2个工程硕士授权领域。
建筑与土木工程学院现有教职工85人，其中专任教师72人，教授（正高）15人，副教授（副高）30人，博士教师比例22.2%。近年来，建筑与土木工程学院在专业建设和教学改革中取得了显著成绩，土木工程、工程力学先后被评为内蒙古自治区品牌专业，土木工程为自治区重点建设专业；结构力学等8门课程被评为内蒙古自治区精品课程；2006年土木工程专业通过全国土木工程专业本科教育评估，并于2011年、2016年顺利通过复评。土木工程实验教学中心被评为“内蒙古自治区实验教学示范中心”，拥有“内蒙古自治区土木工程安全与耐久重点实验室”及“内蒙古自治区建筑结构防灾减灾工程技术研究中心”两个学科平台。