新乡医学院自2003年开始招生四年制药学本科专业，2004年成立药学院。现有药学、药物制剂、临床药学（五年制）3个本科专业；拥有药学一级学科硕士学位授权点、药学硕士专业学位授权点；现有本科在校生785人、硕士研究生65人；设有药理学、药剂学、药物化学、药物分析学、中药学、临床药学6个教研室，1个实验教学中心、1个药物研究所。
药学院有一支爱岗敬业、教书育人、治学严谨、为人师表的高素质教师队伍。药学院现有教职工86人，其中专任教师73名，教授8人，副教授30人，高级职称教师占51%；博士48人，占66%；硕士研究生导师33人，留学归国博士9人。教师分别来自于中国药科大学、沈阳药科大学、复旦大学等20余所著名高校；聘任10余名国内外知名专家为特聘兼职教授。教师中有全国优秀教师2人，河南省优秀专家1人，河南省特聘教授2人，中原科技创新领军人才1人，河南省教育厅学术技术带头人7人，河南省高校科技创新人才2人，河南省青年骨干教师6人，新乡医学院太行学者1人，太行青年学者4人。
药学院始终坚持教学工作中心地位，专业建设和教学质量工程建设稳步推进，教育教学水平不断提高。药学专业为国家级特色专业、河南省一流本科专业、河南省高等学校“专业综合改革试点”，拥有药学省级优秀教学团队，河南省高校药学实验教学示范中心；拥有《药理学》、《天然药物化学》2门省级精品课程，《临床药理学》省级双语教学示范课程、《天然药物化学》省高校精品在线开放课程，《药物分析》和《天然药物化学》2门省一流课程；拥有《有机化合物波谱分析》省研究生教育优质课程。我院教师在各级各类教学大赛中成绩突出，李生莹老师荣获全国高等学校药学类专业青年教师教学能力大赛一等奖；孙祥德老师主持的教改项目荣获第二届医药院校实验教学改革大赛一等奖。药学院多次被评为学校教学工作先进单位。
药学院高度重视学科建设和科研工作。药学学科为河南省一级重点学科；拥有“河南省天然药物研究”院士工作站、河南省心血管重构与药物干预国际联合实验室、3个新乡市重点实验室；先后获批河南省高校科技创新团队、新乡市科技创新团队等；拥有400兆超导核磁、小动物活体成像等教学科研仪器设备4000万元左右。2014年以来，获得各级科研课题76余项，其中国家级项目26项，发表 SCI论文157余篇，获得国家发明专利授权55项。药学院多次被评为学校科研工作先进集体。
药学院始终坚持立德树人，大力推进素质教育，切实提高人才培养质量。积极开展大学生第二课堂和社会实践活动，着力加强学生创新精神和实践能力的培养，努力提高学生的综合素质，人才培养质量稳步提升。2014年以来，本科生获得国家级大创项目25项,校级科研课题37项，获校挑战杯二等奖1项、三等奖1项。学生在国家级大赛中屡获佳绩，荣获2019年第十二届“全国大学生药苑论坛”竞赛创新成果三等奖；荣获第六届全国医药院校药学/中药学专业大学生实验技能竞赛二等奖和三等奖；在2019年第二届全国药学研究生学术研讨会上，分别获得研究报告一等奖、二等奖、优秀奖和最佳壁报奖。本科生就业率96%以上，考研率35%以上，研究生就业率100%。毕业生跟踪调查反馈，用人单位满意度99%，社会认可度较高。药学院多次被评为学校“三育人”工作先进集体。
药学院注重对外交流与合作，广交朋友，共谋发展，与国内外多个高校、科研院所和医药企业建立了良好的协作关系，为药学院的发展创造了有利条件。