大学北京林业大学从1997年开始招收环境科学专业本科生，2003年开始招收环境科学学科硕士研究生。随着我国经济建设的高速发展，对环境保护提出了更高的要求，为了适应国家需求，学校将环境学科作为发展重点，于2007年4月正式成立环境科学与工程学院。环境科学与工程学院2010年获批“环境工程”专业学位硕士授权点，环境科学与工程学院开始招收全日制和在职工程硕士研究生。2011年，环境科学与工程学院获批“环境科学与工程”一级学科硕士点。次年参加国家学科评估，在全国82所参评高校中排名第39位，在硕士点中排名第3。2016年，环境科学与工程学院再次参加国家学科评估，评估结果为B-，在全国155所参评高校中排名第47位。
环境科学与工程学院拥有一支高素质、年富力强、富有创新精神的师资队伍。目前，环境科学与工程学院现有专职教师31名，全部具有博士学位，其中包括教授13名，副教授13名，中级职称教师5名。环境科学与工程学院教师中有多人获得国家和省部级荣誉称号。1人获得国务院特殊津贴，1人获得“青年千人计划”，2人获得“国家优秀青年科学基金”，6人入选“教育部新世纪优秀人才支持计划”，2人获得环保部青年拔尖人才荣誉称号，1人获得北京市青年优秀人才荣誉称号，6人获得北京科技新星荣誉称号。环境科学与工程学院教师面向国家需求，积极参与生态环境保护的科学研究工作。目前承担国家各类课题80余项，并取得一批有影响的科研成果，先后获得国家级奖励4项，省部级奖励13项，获准国家发明专利授权56项。近3年环境科学与工程学院师生在Energy and Environmental Science、Environmental Science and Technology、Water Research、Applied catalysis B: Environmental、Bioresource Technology、Journal of Materials Chemistry A等国际期刊发表SCI论文181篇。
环境科学与工程学院面向国家重大科技需求，结合京津冀协同发展战略，致力于解决复杂生态环境问题的科学研究和高素质专业人才的培养，已形成具有鲜明特色和优势的4个学科方向：（1）水污染控制与生态修复。重点研究面源污染控制、污染水体生态修复与景观构建和有毒难降解有机废水处理技术及产业化应用；（2）固体废物处置与资源化利用。重点研究农林废弃物制肥、沼气生产、化感物质提取以及污泥脱水、高效厌氧消化、堆肥及林业应用；（3）环境功能材料研发与应用。重点研究用于水中重金属、有机污染物和工业废气NOx、CO2及林产品加工中VOCs强化去除的功能材料及工程应用；（4）新兴污染物环境行为与控制。重点研究新兴污染物的分析方法、环境化学行为与控制技术。
环境科学与工程学院学术氛围浓厚。2009年环境科学与工程学院获北京市教委批准筹建“污染水体源控与生态修复技术”工程研究中心（北京市首批），2011年获批北京市重点实验室“水体污染源控制技术”挂牌建设（学校首批）。环境科学与工程学院已建立起国内先进水平的教学与科研实验平台，具有几十套水处理、大气污染控制与膜分离装置的演示模型，拥有ICP-MS、ESR、激光粒度分布仪、XRD分析仪、气质联用仪、气相色谱、液相色谱、离子色谱、傅里叶红外分光光度仪、紫外-可见分光光度仪、荧光分光光度计、总有机碳测定仪、原子吸收仪、表面电位滴定仪、比表面测定仪、元素分析仪、水质多参数分析仪、显微成像分析系统、Bio-rad变性梯度凝胶电泳仪、凝胶成像分析系统、梯度PCR扩增仪、实时荧光PCR扩增仪、电解呼吸仪、全自动发酵罐、低温及超低温冰箱、高速冷冻离心机等一大批先进的仪器和设备。同时环境科学与工程学院制定了一系列管理规则制度，包括教学管理、科研管理、实验室管理、仪器设备管理、人事制度管理等，保证了进行高层次教学和科研训练的需要。
环境科学与工程学院十分重视国际交流与合作，已与美国、英国、加拿大、德国、法国、澳大利亚、日本、韩国等国家在学术交流、专家互访、合作研究等方面建立了良好关系，积极组织本单位师生开展科研活动和学术交流，年均邀请境内外专家来校交流讲座10余人次，师生年均20多人次出国参加各类国际会议，并发表口头报告。