西南交通大学研究生院创建于1984年12月，是国务院首批批准试办的研究生院之一。西南交通大学等十所研究生院受到表彰，并正式挂牌。
作为全国重要的研究生培养基地，西南交通大学研究生院依托学校雄厚的办学实力，为研究生的培养创造了良好的学科环境和师资条件。西南交通大学是目前国内学科门类最齐全的综合性大学之一，可在哲学、经济学、法学、教育学、文学、历史学、理学、工学、农学、医学、管理学和艺术学等12个学科门类授予学术性学位。现拥有博士学位授权二级学科274个(含自主增设54个)，涉及一级学科56个，其中博士学位授权一级学科54个；硕士学位授权二级学科309个(含自主增设56个)，涉及一级学科61个，其中硕士学位授权一级学科60个；博士专业学位类别4种，硕士专业学位类别27种。现有14个一级学科国家重点学科、21个二级学科国家重点学科和10个国家重点（培育）学科，7个农业部重点学科，50个一流学科，形成了重点突出、层次分明、富有特色的重点学科系列。在国家公布的“双一流”建设名单中，学校入选一流大学建设高校（A类），18个学科入选一流建设学科，居全国高校第三。
西南交通大学师资队伍整体实力雄厚，现有中国科学院院士21人、中国工程院院士20人、国家“千人计划”入选者（含青年项目）237人、文科资深教授9人、“973计划”和重大科学研究计划等首席科学家41人、教育部“长江学者奖励计划”入选者（含青年学者）101人、国家杰出青年科学基金获得者129人。截至2017年12月31日，各学科具有研究生招生资格的教师为4046人，其中具有博士生招生资格的教师为2535人；具有专业学位硕士生招生资格的教师为2170人，其中具有专业学位博士生招生资格的教师为255人；副教授562人具有博士生招生资格。
目前拥有国家重点实验室10个，国家（地方联合）工程实验室10个，重点学科实验室1个，国家专业实验室4个以及省部级实验室102个；拥有国家工程技术研究中心4个，国家级协同创新中心2个以及省部级平台中心、基地41个；拥有普通高等学校人文社科重点研究基地3个。高水平的研究生导师队伍和良好的科研实验条件，为开展高水平的研究生教育打下了坚实的基础。
西南交通大学积极推动研究生教育国际化进程,已与多所世界著名高校建立了实质性的校际合作关系。西南交通大学十分注重拓展学生的国际视野，仅2017年，全校共选送2440名研究生通过多种渠道公派出国（境），攻读学位、联合培养、短期访问、参加高水平国际学术会议等。
在长期的办学过程中，西南交通大学以严谨的求是学风培养了大批优秀人才，以执著的创新精神创造出了丰硕成果。从1999年至2017年9月，西南交通大学共授予博士学位20565人，授予硕士学位90587人。共有48篇博士学位论文入选全国百篇优秀博士学位论文，93篇入选全国优秀博士学位论文提名奖。目前西南交通大学在校研究生28795名，其中博士研究生10747名，硕士研究生18048名（其中非全日制硕士研究生1530人）。2017年，招收博士研究生2497名，招收硕士研究生5987名，招收在职人员攻读硕士学位研究生1572名。