南方医科大学南方医院是一所集医疗、教学、科研和预防保健为一体的大型综合性三级甲等医院，全国百佳医院。系南方医科大学（原第一军医大学）第一附属医院、第一临床医学院。医院创建于1941年，2004年8月随大学由军队移交广东省。南方医院综合排名在国内权威排行榜中稳定在15名左右，有15个专科进入中国最佳专科排行榜（复旦版）前十或得到提名，是广东省高水平医院“登峰计划”首批重点建设单位和国家区域中医（风湿病科）诊疗中心。
医院现下辖院本部、增城分院、知识城分院、江高院区，太和分院、新塘医院、泰成逸园分院。院本部坐落在广东省广州市白云山东麓麒麟岗上，拥有广东省花园式院区，曾被评为“全国部门造林绿化400佳单位”。现占地面积20.3万平方米，建筑面积45.8万平方米；展开床位2225张，医疗设备总值近14亿元；2018年门急诊量325.46万人次，年出院人数11.9万人次。增城分院地处广州市东部国家级增城经济技术开发区，目前已正式开业，规划床位1500张，致力于打造为“流程智能化、管理精细化、服务优质化“的智慧型三级甲等医院；新塘医院为二级综合医院，展开床位250张；江高院区地处广州西北部，历史可追溯至清末新西兰传教士开设的普惠医院，院区建筑中西合璧，环境优美，为广州市文物保护单位，现展开床位360张，开设有老年病科、介入科、精神心理科、健康管理科等。
医院设置诊疗科目111个，拥有临床医学一级学科博士学位授权点和临床医学博士后流动站；内科学（消化系病）为国家重点学科，外科学（骨外）为国家重点培育学科；拥有国家临床重点专科建设项目14个，国家中医重点学科4个；设有器官衰竭防治省部共建国家重点实验室、慢性肾病国家临床医学研究中心，国家高等院校学科创新引智基地1个，广东省肾脏病研究所、南方消化病研究所、广东省肝脏疾病研究所。广东省临床重点专科达31个，临床医学获评广东省攀峰重点学科，口腔临床医学获评广东省优势重点学科。“器官衰竭防治研究”项目被评为广东省211工程重点建设项目；在全国率先成立了“健康管理示范基地”、“李可中医药学术流派传承基地”和“古中医疑难杂症治疗中心”。涉外医疗中心惠侨楼创办于1979年，先后共收治91了个国家和地区的11万余名海外各界人士，1995年被中央军委授予“模范医疗惠侨科”荣誉称号，并获江泽民主席亲笔题词嘉勉。
医院现有专业技术人员4271人，其中高级专业技术职务603人,博士生导师118人，硕士生导师131人。有115人担任省级以上学术团体主任委员和副主任委员职务，有28名专家享受国务院政府特殊津贴。其中包括中科院院士1人、国家“973”计划项目首席科学家1名、国家杰出青年基金获得者2名、“新世纪百千万人才工程”国家级人选4名。
经过70余年的发展，医院在消化病诊治、肾病的综合治疗、血液病治疗、心血管病诊治、肿瘤综合和生物治疗、肾、肝及多器官联合移植技术、神经病学与颅脑外科、显微创伤外科、骨科技术、介入诊疗技术、大面积烧伤救治、重大突发事件的应急救治、整形美容、围产医学与辅助生殖、影像诊断、药学等方面形成明显的技术特色与优势。医院的远程医学会诊中心可与广东、云南、海南等省的200余家医疗卫生机构开展远程医学会诊。
医院每年承担着2500余名全日制本科生和1000余名全日制研究生的管理及培养任务，是首批国家级临床教学培训示范中心。临床医学八年制专业获教育部、卫生部卓越医生教育培养计划项目、广东省专业综合改革试点项目，医学影像学为教育部特色专业；全国首批八年制医学教育培养单位之一；卫生部首批专科医师培训基地、临床药师培训基地和人类辅助生殖技术培训基地；有国家精品课程1门、国家级特色专业3个；先后获国家教学成果二等奖1项、广东省教学成果一等奖1项；主编全国统编教材5部。
医院多次获国家“十二五”科技重大专项、国家自然科学基金广东省联合基金等重大课题资助；先后获国家科技进步二等奖8项，中华医学科技奖一等奖1项，有1人获广东省突出贡献奖、1人获“何梁何利奖”、10人获“丁颖科技奖”；自主研发的“全氟丙烷人血白蛋白微球注射剂”取得了国家生物制品I类新药证书；侯凡凡教授在新英格兰医学杂志上发表了原创性论著，影响因子达51.296。
近年来，医院先后获得 “全国百姓放心示范医院”、“全国医院文化建设先进单位”、“中国医院管理协会科技创新奖”、“全国病历质量评比一等奖”等荣誉称号；连年被评为广州市医保AAA级单位和“广州市医保管理先进单位”。在抗震救灾、广州亚运等突发事件和医疗保障工作中均有出色表现，分别被中共中央、国务院、中央军委授予“抗震救灾英雄集体”称号；被第十六届亚运会组委会、广州亚残运会组委会授予“广州市亚运会、亚残运会组委会先进集体”称号。南方医院骆抗先教授先后荣获“时代楷模”、“全国道德模范”荣誉称号。