暨南大学东南亚研究所下设机构有： 亚太经济研究室、东南亚国际关系研究室、东南亚文化教育研究室、 东南亚华人问题研究室、情报资料室、编辑出版室、行政办公室、东南经济咨询培训服务部。
近十年来, 出版了专著、译著、工具书等共约35种: 如《外向型经济理论与实践》、《战后东南亚国家的华侨华人政策》、《新加坡的宏观经济管理》、《台湾的民营经济》、《南朝鲜的经济发展战略演变》、《走向近世的中国与“朝贡”国关系》、《亚太国家的石油天然气勘探开发》、《东南亚区域合作》、《各国经济特区》、《港澳大百科全书》等。