1953年建校伊始，学校即设有马列主义教研室；2000年合校后，组建了独立建制的政治教育系；2007年9月22日华中科技大学马克思主义学院正式成立，是湖北地区最早成立的马克思主义学院，是华中科技大学思想政治理论课教育教学的专门机构。经过十多年的建设和发展，马克思主义学院在学科建设、科学研究、人才培养和社会服务等方面取得了长足的发展。
马克思主义学院下设6个教研室和1个教研中心，即思想道德修养与法律基础教研室、中国近现代史纲要教研室、马克思主义基本原理教研室、毛泽东思想与中国特色社会主义理论体系概论教研室、中国特色社会主义理论与实践研究教研室、科学技术哲学教研室和形势政策课教研中心。马克思主义学院还设有意识形态、马克思主义基本原理、马克思主义中国化、思想政治教育、国外马克思主义5个研究所。
马克思主义学院拥有马克思主义理论一级学科博士点和硕士点，在马克思主义基本原理、马克思主义发展史、马克思主义中国化研究、国外马克思主义研究、思想政治教育5个二级学科招收硕士生和博士生。2012年，华中科技大学马克思主义理论学科被评为湖北省重点学科。在全国第三轮学科评估中，马克思主义学院在121所参评单位中排名并列第31位，位列前25.6%。在全国第四轮学科评估中，马克思主义学院在231所参评单位中排名并列第24位，位列前20%，评估结果为B+。
近年来，马克思主义学院高水平科研成果持续增长，先后承担了国家社会科学基金项目、教育部人文社科研究项目、湖北省社科基金项目等国家和省部级科研项目100余项，其中，国家社科基金重大委托项目1项、教育部哲学社会科学重大攻关项目3项。在《中国社会科学》《马克思主义研究》《哲学研究》《管理世界》等国内外核心期刊上发表论文300多篇，出版专著近50部，其中，数十篇被《新华文摘》《中国社会科学文摘》等全文转载，有5项成果获湖北省优秀社会科学成果奖。
马克思主义学院始终牢牢把握时代契机，创新发展思路，努力提升教学吸引力和学术科研能力，不断推进教学改革，提升马克思主义理论学科的引领作用，培育中国特色社会主义合格建设者和可靠接班人。
新时代，马克思主义学院全体师生凝心聚力，为提升学科自信心和硬实力、为提升学院核心竞争力和学术影响力、为创建重点马院和建设一流学科而不懈奋斗。