福建医科大学医学技术与工程学院成立于2002年9月，现有四年制的医学检验技术、医学实验技术、医学影像技术、眼视光学和康复治疗学等本科专业，拥有医学技术一级硕士学位授权点，临床检验诊断学、眼科学和康复医学与理疗学3个临床医学二级硕士学位授权点。医学技术与工程学院现有在校普通本科学生近1000名，来自全国20多个省、直辖市、自治区和港澳台地区。建院以来，已培养全日制本专科及研究生和成人教育毕业生近10000人，为省内外医疗卫生战线输送了一大批优秀人才，全日制本科学生就业率达95％。
医学技术与工程学院现有专兼职教师423人，其中高级职称244人，博士生导师13人,硕士生导师62人。享受国务院政府特殊津贴专家3人，省级高校教学名师1人，省级优秀专家1人。
医学技术与工程学院始终以教育教学改革和提高人才培养质量为核心，取得良好成绩。医学检验技术、康复治疗学获批为福建省应用型学科，康复治疗学（社区康复与健康管理）专业获评为福建省创新创业教育改革试点专业，医学检验专业获批为省级专业改革综合试点、省级特色专业，医学技术实验教学中心、医学检验技术实验教学中心获评为省级实验教学示范中心，眼科学与视光学教学团队获评为省级教学团队，《临床血液及血液检验》、《临床免疫学和免疫学检验》荣获省级精品课程。教学成果获省级一等奖1项、二等奖2项，校级特等奖1项、一等奖3项、二等奖1项，大学生创新课题百余项。
医学技术与工程学院实验室面积2000多平方米，仪器设备1200余台件，总资产1300余万。近年来，医学技术与工程学院专兼职教师共承担国家、省、部及厅级科研项目60多项；获省科技进步一、二、三等奖20多项；在国内外各级杂志上发表论文700多篇。
医学技术与工程学院与多个国家和地区的知名专家教授建立了良好的学术交流机制。聘请美国康奈尔大学等多所海外院校的知名教授为医学技术与工程学院客座教授，定期来医学技术与工程学院交流讲学；医学技术与工程学院还与荷兰自由大学、台湾元培医事科技大学、香港大学、英国BTL医疗实业集团等建立良好的交流合作关系，每年选送十余名学生赴台湾元培医事科技大学交流学习。